sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "acidocina".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Pogosto skupaj z
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Možno je, da oba gassericina seva K7 oziroma acidocina seva LF221 za transport, procesiranje in izločanje iz celic uporabljata skupen sistem.
Najprej smo določili celotno nukleotidno zaporedje gassericina K7 A in na N-terminalnem koncu dopolnili manjkajoči del nukleotidnega zaporedja acidocina LF221 A.
Nato smo določili še celotno nukleotidno zaporedje gassericina K7 B in na Nterminalnem koncu dopolnili manjkajoči del nukleotidnega zaporedja acidocina LF221 B.
Zato predvidevamo, da do izražanja gassericinov K7 A in B in acidocina LF221 B najverjetneje ni prišlo oziroma bakteriocina nista bila aktivna.
Navzgor od tega proteina pa se nahaja še 465 AK dolg, domnevni, od ATPodvisni transportni protein acidocina LF221 B.
Tudi na novo ugotovljeno nukleotidno zaporedje acidocina LF221 A (285 bp) je bilo identično odgovarjajoči regiji gassericina K7 A.
Ugotovili so popolno ujemanje z nukleotidnima zaporedjema odgovarjajočih regij za acidocina LF221 A in B seva LF221.
Zato smo ga tudi mi izbrali za heterologno tvorbo gassericina K7 A in acidocina LF221 A.
B1 in B3 imata primarno strukturo, podobno peptidoma dvokomponentnega bakteriocina acidocina J1132, izoliranega iz kulture Lactobacillus acidophilus J1132 (Tahara in sod., 1997).
Podobno strategijo kot za gassericin K7 A, smo uporabili tudi pri kloniranju in izražanju gassericina K7 B in acidocina LF221 B.
Pripravili smo nova plazmidna konstrukta za izražanje gassericina K7 A in acidocina LF221 A.
Dobljena nukleotidna zaporedja smo primerjali z 858 nukleotidov že znanega nukleotidnega zaporedja acidocina LF221 A (številka GenBank AY295874; Čanžek Majhenič in sod., 2004).
Tudi v ekspresijskem sistemu E. coli 2747 nismo uspeli potrditi heterolognega izražanja gassericinov K7 A in K7 B ter acidocina LF221 B.
Zato con okoli testiranih transformant nismo mogli označiti kot pozitivni rezultat in smo zaključili, da do izražanja gassericina K7 B in acidocina LF221 B najverjetneje ni prišlo oziroma bakteriocina nista bila aktivna.
V izbranih transformantah smo preverjali izražanje gassericina K7 B in acidocina LF221 B z indikatorskim sevom L. sakei 2714 (spot test s kolonijami; difuzijski test z brezceličnimi supernatanti, s skoncentriranimi in liofiliziranimi brezceličnimi supernatanti).
Predvsem je zanimiva navzkrižna aktivnost homolognih podenot gassericina K7 B (acidocina LF221 B) in gassericina T ter navzkrižna homolognost podenot bakteriocinov obeh sevov s podenotama sakacina T.
Izražanje gassericina K7 B in acidocina LF221 B smo v sevu Lc. lactis IL1403 preverili s pomočjo indikatorskega seva L. sakei 2714 (spot test s kolonijami in difuzijski test z brezceličnimi in liofiliziranimi brezceličnimi supernatanti).
Vendar iz transformant LF221 bac- nismo uspeli izolirati plazmidnih konstruktov, s katerimi bi potrdili (vsaj) prisotnost vstavljenih fragmentov za tvorbo gassericinov K7 A in K7 B ter acidocina LF221 B.
Določili smo dodatnih 42 AK in ugotovili, da je tudi komplementarna podenota acidocina LF221 A (Acd221α) sestavljena iz 15 AK Nterminalnega vodilnega peptida (dvoglicinskega tipa) in 64 AK bakteriocinskega prekurzorja, tako kot komplementarna podenota GasK7a.
Sklepamo, da do izražanja gassericinov K7 A in K7 B ter acidocina LF221 B v sevu Lc. lactis IL1403 najverjetneje ni prišlo, oziroma z uporabljenimi testi za preverjanje izražanja nismo zaznali bakteriocinske aktivnosti.