MACPFdomena je zelo ohranjena in prisotna praktično pri vseh taksonomskih skupinah razen pri arhejah
Pri krenarhejah poteka tudi obratni reverzni Krebsov cikel, pri pravih arhejah pa reduktivna acetil-CoA
CO in vodika zemeljski plin poteka izredno nadzorovanem bioreaktorju katerem živijo mikroorganizmi arheja
Pri nekaterih arhejah se celični steni pojavlja soroden polimer imenovan psevdopeptidoglikan kjer sta
Gensko prepisovanje in prevajanje pri arhejah je bolj podobno tistemu ki poteka pri evkariontih kot pa
Tak primer bi lahko bila metanogena arheja Methanobrevibacter smithii ki je najpogostejša arheja črevesni
bakterijkih kromosomih se običajno nahaja le ena začetna točka podvojevanja oziroma replikacije pri nekaterih arhejah
Prokariontski homologi proteinov Ago in RdRP kažejo razpršeno porazdelitev arhejah in bakterijah in omejeno
Pri nekaterih arhejah se v celični steni pojavlja soroden polimer, imenovan psevdopeptidoglikan, kjer
raziskovalcev Univerze Yale uspelo pojasniti kristalno strukturo linezolida vezanega na ribosomsko podenoto pri arheji
Ti encimi so se razvili v bakterijah in v arhejah kot obrambni mehanizem pred virusi.
Med arhejami ima največji kromosom Methanosarcina acetivorans skoraj milijoni baznih parov najmanjšega
N-glikozilacija poteka pri evkariontih in arhejah, v prokariontih zelo redko.
primerjalna študija genomike nakazuje tudi da je družina argonavtov Ago ki je prisotna evkariontih arhejah
Univerze Yale uspelo pojasniti kristalno strukturo linezolida, vezanega na ribosomsko podenoto 50S pri arheji