Zaradi visoke simetrije je strukture virusnih kapsid razmeroma preprosto razrešiti, najpogosteje z rentgensko kristalografijo ali krioelektronsko mikroskopijo.

Za lažjo primerjavo smo tudi za scAAV izvedli preračun deleža polnih delcev s pomočjo titrov genoma in kapsid.

Za celostno primerjavo je smiselno izvesti še analizo integritete genoma ter kapsid, oziroma stabilnosti kapsid.

Za celostno primerjavo bi bilo smiselno izvesti še analizo integritete genoma in kapsid ter določitev infektivnih delcev za obe vrsti vektorjev.

Visok odstotek polnih kapsid lahko vodi do zmanjšane količine odmerka.

V tem primeru ne ločujemo praznih in polnih kapsid in je metoda zato ustrezna za določitev skupnega kapsidnega titra.

V frakciji z očiščenim virusom smo pričakovali najvišji delež polnih kapsid ter najmanjšo vsebnost nečistot.

Uporablja se jo za določanje vsebnosti kapsid in je validirana metoda za testiranje ob sproščanju produktov na trg.

Torej, kjer smo določili najvišji titer kapsid, smo določili tudi najvišji titer virusnega genoma in obratno.

To kaže na to, da višja fluorescenca ne pomeni le višjega titra kapsid rAAV, temveč tudi več nečistot.

To je lahko posledica prispevka višje vsebnosti praznih kapsid.

Titer kapsid predstavlja vse kapside neodvisno od vsebovanega genoma.

Titer kapsid pa predstavlja vse kapside vzorca, ne glede na njihovo vsebino.

Titer genoma in kapsid rAAV kažeta sposobnost, varnost in učinkovitost izdelka.

Tako smo lahko izračunali delež intaktnih polnih kapsid.

Razmerje vsebnosti kapsid predstavlja razmerje med koncentracijo polnih in vseh kapsid ter nakazuje na vsebnost praznih oziroma delno polnih kapsid.

Problem pojava praznih kapsid se rešuje s prečiščevanjem pripravkov po proizvodnji vektorjev rAAV.

Pri scAAV smo v povprečju določili nekoliko višje vrednosti titrov kapsid in virusnih genomov, ter nižje vrednosti nečistot, v primerjavi z ssAAV.

Pri metodah z nizko resolucijo je signal delno polnih kapsid nejasen v primerjavi s signali praznih in polnih kapsid.