sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "medip".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Pogosto skupaj z
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
MeDIP je bila kot metoda prvič opisana leta 2005, ko so jo uporabili pri proučevanju metilacijskih vzorcev rakavih celic.
Vlagatelju ni razumljiv argument , kako naj bi oddaja ponudbe ponudnika Medip , d. o. o. , kazala na jasnost in nedoumnost razpisne dokumentacije .
Za posamezno regijo se določijo še točke MeDIP kot normalizirano število prebranih zaporedij glede na dolžino te regije.
Analiza je izvedena v dveh delih - imunoprecipitaciji metiliranih fragmentov genoma (MeDIP) sledi sekvenciranje teh fragmentov.
Nato vzamemo del vzorca in izvedemo MeDIP, del pa ga prihranimo za primerjavo.
MeDip je hitra in enostavna metoda ločevanja metiliranih in nemetiliranih fragmentov DNA.
V vsakem setu podatkov (MeDIP in MBD) smo izbrali po eno regijo za potrjevanje obogatitvene metode in bioinformatske analize.
Slika 12: Presek miRNA s spremenjenim metilacijskim statusom promotorja (MeDIP miRNA) in miRNA, ki se potencialno vežejo na izbrane štiri circRNA.
Knjižnice obogatene z MBD so imele višjo vsebnost gvanina in citozina (63,3 %) v primerjavi s knjižnicam, ki smo jih obogatili z metodo MeDIP (49 %).
V skupini MeDIP miRNA je 183 miRNA s spremenjenim metilacijskim statusom promotorja.
Prav tako so uporabili metodo MeDIP, vendar niso sekvencirali celotne obogatene DNK, temveč so uporabili tehnologijo mikročipov.
Oba gena sta bila sicer identificirana kot hipermetilirana v bioinformacijski analizi genomskih podatkov (MeDIP in MBD).
Tako sekveniranje z bisulfatom kot MeDIP tehnologija sta bili prilagojeni za uporabo z DNA mikromrežami .
Vodoravna prekinjena črta predstavlja mejno vrednost statistične značilnosti, in sicer q < 0,06 za MeDIP podatke, ter q < 0,15 za MBD podatke.
Višja občutljivost metode MeDIP za regije z manjšo gostoto CpG je verjetno posledica same denaturacije vzorca (DNK), pred začetkom postopka obogatitve.
Obogatitev z metodo MeDIP favorizira regije z nižjo CG gostoto, v primerjavi z metodo MBD (96), kar smo opazili tudi pri naših podatkih.
Raziskovalna skupina s Cipra je kot prva povezala metodo MeDIP s prenatalno diagnostiko anevplodij [26].
S končnim štetjem s featureCounts algoritmom, z upoštevanjem FDR, smo identificirali 17 regij v MeDIP obogatitvi in 7 regij v MBD obogatitvi.
Tretji postopek temelji na imunoprecipitaciji metilirane DNA (MeDIP) izolirane iz krvi nosečnice.
Bioinformacijska analiza z MeDIP obogatene knjižnice je identificirala 352.451 kandidatnih vrhov, z MBD obogatene knjižnice pa 100.902 kandidatnih vrhov.