sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "mucb".
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Zaporedja, ki smo jih dobili od podjetja, smo primerjali s pričakovanimi zaporedji mucA in mucB.
Fragmenta mucA in mucB ter začetne oligonukleotide smo od proizvajalca prejeli v liofilizirani obliki.
Na podlagi teh rezultatov lahko sklepamo, da vrednost pH ne vpliva na hemolizo mešanice izbranih glivnih egerolizinov v kombinaciji z MucB.
Z rumeno je označen signalni peptid MucB, ki smo ga za namen izražanja rekombinantnega proteina iz zapisa za protein odstranili.
S testom hemolize govejih eritrocitov smo pokazali, da MucB v kombinaciji z že biokemijsko opredeljenimi egerolizini ni hemolitičen.
Ker je protein MucB relativno velik protein (54 kDa), se v celicah izraža v obliki inkluzijskih telescih v netopni obliki.
Zato smo za izolacijo MucB uporabili sediment celic, ki smo ga pridobili po sonikaciji.
Po reakciji PCR smo izvedli agarozno gelsko elektroforezo, kjer smo pričakovali velikost fragmenta mucA pri 420 bp, velikost fragmenta mucB pa pri 1515 bp.
Preglednica 20: Sestava popolne ligacijske mešanice, pozitivne kontrole in negativne kontrole za vektor pET28a in fragment mucB.
Z rdečo je označeno območje, kjer je pričakovana velikost proteina MucB.
Možna razlaga je prisotnost dodatnih 15 aminokislinskih ostankov na C-koncu MucB, ki lahko vplivajo na zvitje proteina ali onemogočajo učinkovito tvorbo por.
S testom hemolize na govejih eritrocitih smo želeli preveriti ali je mešanica proteinov MucA in MucB hemolitična za goveje eritrocite.
Z izvajanjem poskusov na govejih eritrocitih smo ugotovili, da testirani proteinski pari egerolizin/MucB niso hemolitični pri fiziološki vrednosti pH (Slika 20).
Na Sliki 20 prikazujemo potek hemolize pri fiziološki vrednosti pH 7,4, kjer smo v proteinskih mešanicah uporabili MucB in druge že omenjene glivne egerolizine.
Za pripravo zrelega MucB, smo tako na nivoju zapisa za MucB odstranili nukleotide, ki so kodirali za prvih 43 aminokislinskih ostankov.
S tem smo dobili zaporedje za zrel protein MucB.
Za pripravo rekombinantnih proteinov smo zato zapis za MucA vnesli v vektor pET21c, zapis za MucB pa v vektor pET28a.
Na Sliki 19 je prikazan proces izolacije proteina MucB iz inkluzijskih telesc, njegovo zvijanje ter izolacija z nikelj-afinitetno kromatografijo.
Molsko razmerje med egerolizinom in MucB v poskusu je bilo 10:1, kjer je bila končna koncentracija egerolizina 5 µM, končna koncentracija MucB pa 0,5 µM.
Prvi cilj magistrske naloge je bil uspešna priprava rekombinantnih plazmidnih vektorjev z zapisom za MucA in MucB.