Ruminococcus flavefaciens sodi med najpomembnejše celulolitične bakterijske vrste v vampu prežvekovalcev in debelem črevesu monogastričnih rastlinojedih sesalcev .

V preglednici 1 so prikazani iz literature zbrani podatki o zmožnosti razgrajevanja posameznih oblik celuloze različnih sevov bakterij rodu Ruminococcus.

Ruminococcus albus (seva 8 in 20) izraža proteine homologne pilinom PT4a, ki so domnevno pomembni za vezavo na celulozo.

Mnenja stroke se razhajajo , nekateri pripisujejo ločen enterotip tudi rodu bakterij Ruminococcus .

Glavne bakterije, ki v prebavilih prežvekovalcev razgrajujejo celulozo, so: Ruminococcus sp.

Predstavniki rodu Ruminococcus veljajo sicer za nesporogene mikroorganizme, a vendar so določene vrste uspele preživeti alkoholni šok (Browne in sod., 2016).

Preglednica 1: Sposobnost razgradnje različnih oblik celuloze bolje proučenih vrst in sevov rodu Ruminococcus, kot jih navaja literatura.

Tretji enterotip je manj izrazit, zanj je značilna nekoliko večja populacija rodu Ruminococcus znotraj debla Firmicutes.

To so sevi Ruminococcus sp., ki imajo v genomu ohranjeno gensko gručo pil, in E. siraeum.

Bakterija Ruminococcus flavefaciens je prisotna v prebavilih rastlinojedih sesalcev (Schleifer, 2009) in ima pomembno vlogo pri razgrajevanju vlaknin.

Nekaj nejasnosti je pri umestitvi vrst Ruminococcus gnavus in Ruminococcus torques v rod.

Preglednica 20: Primerjava rezultatov bioinformatske napovedi substratne specifičnosti z rezultati gojitvenih metod za sev Ruminococcus bicirculans 80/3.

Z naraščanjem vnosa laktuloze so določili tudi povečano rast Bifidobacterium spp. ter zmanjšano rast Provotella spp. in Ruminococcus spp..

CAG:403), v drugem pa dejanska bakterija Ruminococcus sp.

Z "in silico" analizo genoma so pri Ruminococcus biciruculans 80/3 na kromosomu I identificirali lokus pilA1-pilA2, ki najverjetneje kodira pilina PT4a.

Tako posredno znižuje raven metanogeneze, obenem pa poveča delež celulolitičnih bakterij iz rodov Ruminococcus in Fibrobacter (Hamilton in sod., 2010).

Ti se razlikujejo glede na vsebnost enega od prevladujočih bakterijskih rodov Bacteroides (enterotip 1), Prevotella (enterotip 2) ali Ruminococcus (enterotp 3).

Rodovi Clostridium, Paenibacillus in Ruminococcus se pojavijo v vseh štirih fazah, najpogostejši pa so v acidogenezi.

Enterotip 1 opredeljuje rod Bacteroides, enterotip 2 rod Prevotella, medtem ko je enterotip 3 opredeljen z rodom Ruminococcus.

Prispevek je del doktorske disertacije z naslovom » Celulolitični sistem sevov 007C in 007S bakterije Ruminococcus flavefaciens « , ki jo je doc. dr.