sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "umudab".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Pogosto skupaj z
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Transkripcija gena ddrR poteka drugače kot za umuDAb, ki je ponavadi lociran zraven ddrR in imata skupno promotorsko regijo.
Gena umuDAb in ddrR se na genomu nahajata en zraven drugega, med njima pa obstaja intergenska regija, velika 282 baznih parov.
Oba gena sta na promotorju koordinirano regulirana, ta pa vsebuje samo eno UmuDAb vezavno mesto.
Lokus z genoma umuDAb in divergetno izraženim ddrR je značilen za vrsto A. baumannii [40].
Promotorja za gene umuDAb in ddrR se prekrivata, zato UmuDAb z vezavo represira transkripcijo obeh genov in blokira dostop RNA-polimerazi.
Za pozitivno kontrolo smo uporabili vezavno interakcijo UmuDab in DdrR proteina, saj je interakcija med njima zagotovljena in že preverjena.
DdrR in UmuDAb namreč delujeta tudi kot aktivatorja določenih genov, katerih delovanje in funkcija se povišata po poškodbi DNA.
V procesu pridobivanja DdrR, UmuDAb in bakteriofagnih represorjev smo, v prvem koraku, s transformacijo prenesli plazmid v celice.
DdrR z UmuDAb deluje kot korepresor za specifičen set polimeraz, ki popravljajo DNA tudi z uvajanjem napak.
Od teh 39 genov, jih 17 nadzoruje skupaj z regulatorjem UmuDAb, 22 genov pa nadzoruje samostojno.
Slednje nakazuje, da protein DdrR, poleg z UmuDAb, tudi s fagnimi represorji uravnava prepis genov bakteriofagov.
DdrR ne utiša vseh genov, ki se aktivirajo s poškodbami DNA, temveč je korepresor regulona UmuDAb.
V tej regiji se nahaja tudi palindromsko vezavno operatorsko mesto, na katerega se veže protein UmuDAb (Aranda in sod., 2013).
Filogenetsko je UmuDAb bolj podoben UmuD in njegovim homologom, kajti z njim si deli 42-46 % identičnost v aminokislinskem zaporedju.
V sodelovanju z UmuDAb, v tej bakteriji nastopa še mali protein neznane funkcije, imenovan DdrR.
Dokazali smo tudi, da je cepitev UmuDAb močno inhibirana, če je ta vezan na DNA.
Ker se promotorja obeh proteinov na mestu -35 prekrivata, represor UmuDAb prepreči izražanje obeh genov hkrati (Peterson in sod., 2019).
Uporabili smo UmuDAb operatorje genov, katerih dostopne številke GenBank so navedene v legendi slike.
Geni, ki jih nadzirata tako UmuDab kot DdrR, se razdelijo v dve skupini.
Poseganje v UmuDAb regulon in protein RecA bi lahko bila učinkovita strategija za zmanjšanje okužb z A. baumannii.