sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "celotnih nukleotidnih zaporedij".
Kliknite za poizvedbo
Širši sorodni izrazi
Izrazi, ki navajajo celotnih nukleotidnih zaporedij med svojimi sorodnimi izrazi, a jih seznam zgoraj ne doseže. Njihova podobnost je nižja od podobnosti zadnjega izraza nad njimi.
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Slika 8 prikazuje matrično mapo (angl. heatmap), kjer barvna skala predstavlja delež medsebojnega nukleotidnega ujemanja oz. odstopanja med vsakim od 190 celotnih nukleotidnih zaporedij.
Tradicionalna klasifikacija papilomavirusov temelji na podlagi skladnosti ali razlikovanja celotnih nukleotidnih zaporedij gena L1 in topologije filogenetskih dreves.
Določitev celotnih nukleotidnih zaporedij MCV omejuje predvsem odsotnost uspešnega modela gojenja virusa in vitro.
V genskih bankah je bilo tako po zaključku naše raziskave objavljenih 190 celotnih nukleotidnih zaporedij HPV-6 (vključno z našimi 130 celotnimi nukleotidnimi zaporedji).
Trenutna klasifikacija vseh papilomavirusov temelji na primerjavi celotnih nukleotidnih zaporedij gena L1.
V primeru poravnave celotnih nukleotidnih zaporedij smo vsa zaporedja poravnali tako, da so se začela s prvim ATG odprtega bralnega okvirja E6.
Pomembno povečati število celotnih nukleotidnih zaporedij HPV-6/-11, ki so dostopna v genskih bankah.
Med PV različnih rodov, ki so označeni z grškimi črkami alfa-omega, je skladnost celotnih nukleotidnih zaporedij genov L1 nižja od 60 %.
Genomska raznolikost vseh 190 celotnih nukleotidnih zaporedij HPV-6 je predstavljena v preglednici 8.
Tem kriterijem je ustrezalo 48 celotnih nukleotidnih zaporedij HPV-6, na podlagi katerih smo prav tako izrisali filogenetsko drevo (Slika 9).
Genomska raznolikost vseh 63 celotnih nukleotidnih zaporedij HPV11 je predstavljena v preglednici 11.
Analiza celotnih nukleotidnih zaporedij je pokazala, da je genom HPV-11 precej manj raznolik kot genom HPV-6.
Poravnave celotnih nukleotidnih zaporedij MCV smo pripravili s programom mafft v7.310 (Katoh in sod., 2002) z nastavitvijo "--auto".
S primerjavo celotnih nukleotidnih zaporedij HPV-6/-11 smo opredelili linijsko in podlinijsko-specifične SNP-je.
Slika 9: Filogenetsko drevo in razlike parov nukeotidnih zaporedij na podlagi 48 celotnih nukleotidnih zaporedij HPV-6.
V naši raziskavi smo opredelili 130 novih celotnih nukleotidnih zaporedij HPV-6 in 14 novih celotnih nukleotidnih zaporedij HPV-11.
Prve sistematične primerjave celotnih nukleotidnih zaporedij HPV-11 so bile opravljene nedavno v Sloveniji.
Slika 14: Filogenetsko drevo in razlike parov nukeotidnih zaporedij na podlagi 63 celotnih nukleotidnih zaporedij HPV-11.
Kocjan in sod., 2013 Nadaljevanje preglednice 3: 60 celotnih nukleotidnih zaporedij HPV-6, objavljenih v genski banki GenBank do začetka izvajanja naše raziskave.
Na podlagi analize 63 celotnih nukleotidnih zaporedij L1 HPV-11 smo odkrili 33 (2,19 %) nukleotidnih zamenjav in 13 aminokislinskih zamenjav (2,59 %).