Črna krepka krivulja predstavlja povprečen populacijski model kontrolnega vzorca, rdeča krepka krivulja pa povprečen populacijski model tretmaja (posamezne circRNA).

Za vsako circRNA orodje uporabi hipergeometrični test, da preveri, ali so identificirani circRNA-mRNA pari statistično značilno koregulirani z miRNA.

Za vsakega od treh bralnih okvirov je bil ohranjen le najdaljši cORF, saj ima circRNA z dolgim cORF več možnosti za prevajanje.

Za preučevanje funkcije in biogeneze circRNA se pogosto uporabljajo vektorji za prehodno prekomerno izražanje circRNA pod nadzorom močnega promotorja (npr.

Za iskanje prileganja smo v iskalnik vnesli circBase identifikacijsko številko posamezne circRNA.

Vse izbrane circRNA so eksonske in so različno dolge.

Vmesni introni se v nadaljevanju v večini primerov odstranijo s spajanjem znotraj lariatne strukture, nastali molekuli pravimo eksonska circRNA.

Vektorska shema predstavlja osnovno zgradbo vektorja pRR z vstavljenim zapisom za poljubno izbrano circRNA.

V podatkovni zbirki riboCIRC za nobeno izbrano circRNA nismo našli eksperimentalno potrjenih circRNA peptidov, zato smo se poslužili napovedne metode.

V cirkadianem eksperimentu smo preko bioluminiscenčnega reporterja spremljali potencialen vpliv prekomerno izraženih circRNA na spremembo cirkadianega ritma celic.

Sterilno izolirani vektorji so nam služili v postopku transfekcije kot platfome, iz katerih so se prekomerno izražale izbrane circRNA.

S to metodo smo preverili, ali je bila transfekcija celic uspešna in ali so se v celicah circRNA prekomerno izrazile.

Razlika v akrofazi predstavlja velikost učinka circRNA na celice in je prikazana v radianih [rad], urah [h] in procentih [%].

Pri tem moramo tudi paziti, saj rezultati testa razlike amplitud za vse circRNA niso povsem zanesljivi zaradi različnih akrofaz primerjanih vzorcev.

Preverili smo tudi, kje v celici se naše circRNA verjetneje nahajajo.

Pred potekom spajanja circRNA se mora med prepisovanjem pre-mRNA delno zviti.

Poročali so tudi, da se circRNA prenašajo z eksosomi.

Poleg vsega pa riboCIRC omogoča tudi ugotoviti, ali so potencialno prevedljive circRNA ohranjene med vrstami.

Poimenovanje circRNA smo sestavili iz besede "circ" in simbola gena, iz katerega se circRNA prepisuje.

Nekatere circRNA pa se tudi prevajajo, delujejo kot vir psevdogenov ali pa vir informacij za sosednje celice (se izločajo z eksosomi).