sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "ghkl".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Le-ta tvori interakcije z aminokislinskimi ostanki, ki so večinoma na vmesnih zavojih, ki pa se med posameznimi predstavniki GHKL naddružine razlikujejo.
ATP-azami iz družine GHKL, so v vezavnem mestu določene razlike, zato sta primerni tarči za doseganje selektivne toksičnosti (15, 18).
Ta kratka zanka sega v ATP vezavni žep GHKL domene in je glede na eksperimentalne podatke pomembna za komunikacijo med domenami [61].
Nadalje smo raziskovali in proučevali podobnosti znotraj družine GHKL.
Na domeni GHKL je tudi vezavno mesto za ATP, na katerega bomo načrtovali zaviralce v tej magistrski nalogi.
Spada v naddružino GHKL in ima visoko strukturno podobnost s histidin kinazami, DNA-girazami in topoizomerazami.
Čeprav obstaja nizka homologija primarnega zaporedja med člani GHKL, se sekundarne strukture njihovih ATP-vezavnih domen dobro prekrivajo [52, 59].
Ta lizin naj bi povezal hidrolizo ATP z relativnim gibanjem med GHKL in pretvorniško domeno.
Sprememba konformacij pretvorniške in GHKL domene je pomembna pri potovanju DNK skozi katalični cikel giraze.
Značilnost funkcionalno zelo različnih članov GHKL superdružine so karakteristična AK zaporedja, ki skupaj tvorijo specifično nukeotidvezočo zvitje poznano pod imenom Bergeratovo zvitje.
Ko podrobneje proučimo strukturo GHKL podenote, lahko opazimo poseben strukturni element, ki sestavlja ATP vezavno mesto teh dveh encimov, imenovan Bergeratovo zvitje.
V drugem koraku se v vezavna mesta na GHKL domenah vežeta dve molekuli ATP.
NTD rečemo tudi domena GHKL (označena z rumeno), CTD pa sestavljata pretvornik (označen z oranžno) in domena TOPRIM (označena z rdečo).
Večina aminokislinskih ostankov, ki sodelujejo pri vezavi ATP, se nahaja na GHKL domeni.
Šaperon Hsp90 spada v družino proteinov z ohranjeno domeno GHKL, v kateri imajo vsi člani zelo podobno strukturo ATP-vezavnega mesta (13).
V domeno GHKL se veže ATP in na tak način katalizira dimerizacijo N-vrat, da se zaprejo.
N-vrata sestavljajo N-terminalne domene: po dve domeni GHKL (ang.
GyrB je sestavljena iz treh delov: GHKL ali N-terminalnega dela in pretvornika ter domene TOPRIM, ki skupaj tvorita C-terminalni del.
Kljub nizki homolognosti sekvenc proteinov iz družine GHKL, se 3D strukture njihovih ATPaznih domen zelo dobro ujemajo.
N-končna domena (NKD) vsebuje ATP-vezavno mesto, ki je homologno girazam, histidin kinazam in topoizomerazam, kar Hsp90 uvršča v naddružino GHKL.