Z enkapsulacijo encimov, ki sodelujejo v razgradnji substrata je celica zaščitena pred toksičnim intermediatom propionaldehidom, ki je produkt prve encimske reakcije.

Tvorba amidne vezi poteče po mehanizmu nukleofilne substitucije s tetraedričnim intermediatom.

Temperaturo tališča smo določali vsem vmesnim intermediatom in končnim spojinam, ki so pri sobni temperaturi v trdnem agregatnem stanju.

Smisel kromatografskega čiščenja smo videli tudi v tem, da bi tako vstopili v zadnjo fazo sinteze sulfonilsečnin s čistim skupnim intermediatom.

Sintezno pot holesterola lahko v grobem razdelimo na del pred lanosterolom, prvim sterolnim intermediatom, in po njem.

Pri tem nastane kloridni anion, ki reagira z nestabilnim intermediatom, tako da nastanejo kislinski klorid, ogljikov dioksid in ogljikov monoksid.

Pri reakciji izbranega alkohola z intermediatom se tvori želeni ester, kot stranski produkt pa dobimo ureo uporabljenega karbodiimida.

Pri fotoredoks procesu katalizator absorbira foton, preide v vzbujeno stanje ter izmenja elektron s substratom, reagentom ali intermediatom.

Popolno razumevanje mehanizma reakcije utrjevanja zaradi kompleksnosti premreževanja in izredno zahtevne sledljivosti posameznim intermediatom še ni povsem raziskano.

Nastane anion, ki reagira z aktiviranim karboksilatnim intermediatom in pri tem tvori aktiviran ester.

Nastali anion nato reagira z novonastalim aktiviranim intermediatom iz karboksilne kisline in tvori aktivirani ester.

Namreč, s tvorbo vodikove vezi med acetonom in hidrotrioksidnim intermediatom se signal za hidrotrioksidni proton običajno izostri.

Jod je reagiral z vinilnim intermediatom, brom pa je ostal prost.

Elektrofilnim fragmentom ter nekaterim sinteznim intermediatom smo s fluorimetričnim testom določili zaviralno aktivnost na kaspazi-1.

Amidno vez med intermediatom 10 in ustreznimi heterocikličnim gradniki - štirimi sintetiziranimi in dvema kupljenima - smo pripravili na dva različna načina.

Temu je sledila dvostopenjska ciklizacija z vmesnim intermediatom, s katero smo dobili biciklični naftiridinski skelet z metoksi in hidroksi skupino (17).

Prav tako pa smo inhibitorno aktivnost določili vsem intermediatom iz druge serije spojin, kar pomeni, da smo inhibitorno delovanje določili 42 spojinam.

Nukleofilna substitucija na karboksilnih spojinah poteka po mehanizmu nukleofilne substitucije s tetraedričnim intermediatom ( slika 2 - 2 ) .

Kondenzacija amina s sinteznim intermediatom iminom (1) lahko vodi do nastanka sekundarnega amina (3), z nadaljnjo kondenzacijo pa tudi do terciarnih aminov (4).

Vpliv benzilidenpirolin-4-ona 1i na ciklizacijsko stopnjo je bil izrazitejši, kljub temu, da benzilidenpirolin-4-on 78i ne reagira direktno z intermediatom.