Vodikova vez je intermolekularna ali intramolekularna interakcija med vodikovimi atomi in kisikovim, fluorovim, dušikovimi ali drugimi močno elektronegativnimi atomi.

Vez se lahko vzpostavi znotraj ene molekule (intramolekularna) ali med dvema različnima molekulama (intermolekularna).

V viskoznih medijih se omeji intramolekularna rotacija, ki spodbuja neradiativni razpad, in fluorescenca postane prednostna pot deaktivacije fotovzbujenega stanja.

V primeru zamenjave nitrila z estersko skupino reakcija najverjetneje poteče do želenega produkta, čemur pa takoj sledi intramolekularna aminoliza estra.

V obeh primerih je ključni korak intramolekularna premestitev arila.

V naslednjem koraku žveplova kislina protonira dušik ciano skupine, temu pa sledi intramolekularna elektrofilna aromatska substitucija.

Temu sledi ciklizacija, intramolekularna tvorba etra med hidroksilnima skupinama v intermediatu, in tako dobimo zaprt obroč ter s tem ustrezen ksanton.

Takšen proces lahko poteče kot intramolekularna ciklizacija ali kot intermolekularna reakcija.

Pripravili smo tudi nekaj pirazolidinonov, kjer bi bila možna intramolekularna adicija radikala na dvojno vez.

Pri zamenjavi nitrilne za estrsko skupino reakcija sicer poteče, a takoj po nastanku produkta poteče intramolekularna aminoliza estra.

Pri višji temperaturi poteka intramolekularna ciklizacija z napadom končne aminske skupine na benzilno estrsko skupino.

Pri samem postopku izolacije in čiščenja spojine je očitno prišlo do njene kemijske spremembe (oksidacija, cepitev vezi, intramolekularna ciklizacija).

Podaljševanju verige običajno sledi intramolekularna kondenzacija in aromatizacija linearnih intermediatov.

Po tvorbi α-diazo-β-keto estra poteče intramolekularna kelotropna cikloadicija, pri čemer nastane ciklopropanski obroč.

Po odcepu vode in tvorbi dvojne vezi, se prične drugi del reakcije, in sicer intramolekularna ciklizacija.

Nato se tvori intramolekularna vez, ko hidroksilna skupina napade izocianidno skupino, pri čemer nastane oksazolni obroč.

Nastali kation-radikal je resonančno stabiliziran z atomom dušika, v naslednjem koraku pa poteče intramolekularna adicija radikala na dvojno vez.

Lahko pa jih pripravimo, tako da αoksoketen ditioacetale deprotoniramo na tiometilni skupini in temu sledi intramolekularna aldolna kondenzacija.

Koncentrirana žveplova kislina zelo močno veže vodo in jo lahko odvzame tudi iz molekul organskih spojin (intramolekularna dehidratacija).

Ker je mucinska kislina v metanolu slabo topna, pri danih pogojih veliko hitreje poteče esterifikacija s topilom, kot bi potekla intramolekularna esterifikacija.