Za najbolj donosno gojišče se je izkazalo gojišče MSgg s povečano koncentracijo glicerola, ki je ponujalo največjo pozitivno razliko med surovima izolatoma.

Strjene agarske plošče MSgg, ki služijo za podlago za samosestavljanje sintetičnega biofilma ob hkratni delni dehidraciji smo preko noči sušili v laminariju.

Pri vseh poskusih smo uporabili gojišče MSgg s povečano koncentracijo glicerola, razen pri poskusih, kjer smo testirali različna gojišča z namenom optimizacije.

Za kolonizacijo biofilma na korenini je pomembna sposobnost tvorbe biofilma, zato smo to predhodno preverili na trdnem gojišču MSgg.

V časovni točki 16 h smo na gladini gojišča MSgg ponovno zaznali prisotnost celic, ki so prišle na površje iz potopljenega pelikla.

Rast smo spremljali v gojišču MSgg v mikrotitrskih ploščah s 96-luknjicami z merjenjem emitirane svetlobe različno označenih fluorescenčnih reporterskih genov.

Omenjena masa peleta vsebuje podobno maso celic, kot jih najdemo pri nativnem biofilmu na MSgg gojišču v 90 mm petrijevi plošči.

Namen poskusa je bil preveriti rast in morfologijo biofilma (kolonije) uporabljenih sevov na trdnem gojišču MSgg.

Biofilm smo s trdnega gojišča MSgg postrgali z objektnim stekelcem in ga resuspendirali v 10-kratnem volumnu fiziološke raztopine.

V gojišču MSgg biofilm torej ne vpliva na frekvenco transformacije v začetnem stadiju rasti kulture.

Dejstvo je tudi, da je transformacija v MSgg zelo nizka, kar naredi opažene razlike vprašljive.

Kot gojišče smo v obeh primerih uporabili minimalno gojišče MSgg s povišano koncentracijo glicerola.

Kulturo smo nato redčili v tekočem MSgg gojišču tako, da je bilo v redčitvi le 1,6 % prekonočne kulture.

Za gojenje statičnih kultur smo uporabili mikrotitrske plošče z 12 luknjami, kamor smo odpipetirali po 4 mL gojišča Msgg oz.

Za spremljanje morfološke dinamike preko krajšega časovnega obdobja (15 h) smo v vsako mikrotitrsko luknjico dodali 1000 µL medija MSgg in 5 % bakterijskega inokuluma.

Za spremljanje morfološke dinamike preko daljšega časovnega obdobja (65 h) smo v vsako mikrotitrsko luknjico dodali 1250 µL medija MSgg in 5 % inokuluma.

Najprej smo razlili 20 mL gojišča MSgg v 90 mm petrijevko, ki služi kot podlaga za sestavljanje sintetičnega biofilma.

Mi smo sledili izmenjavi genov za odpornost na antibiotik v gojišču MSgg.

Kulturi sta bili gojeni v erlenmajericah v gojišču MSgg z dodanim glicerolom.

Za tem smo biomaso sprali s 5 ml tekočega MSgg gojišča za sintetični biofilm.