Širši kot je izbran nabor rastlinskih vrst (filogenetsko oddaljene rastline) za določanje ortolognih skupin, večje in manj natančne so ortologne skupine.

Črke predstavljajo gene, katere so različni algoritmi določanja ortolognih skupin in izbranih rastlinskih vrst uvrstili v drugačne ortologne skupine.

Zadnji nujni gradnik baze predstavlja vključitev različnih tipov ortolognih skupin.

Z drugimi evkarionti jo povezuje velik delež ortolognih genov in podobno uravnavanje nekaterih signalnih poti.

Vrednosti razrednega atributa (ang. class attribute; je ortolog / ni ortolog), smo izpeljali iz samih ortolognih skupin orthoMCL.

V tem primer smo proteine primerjali s programom mmmscan na bazo vseh bakterijskih ortolognih skupin.

Uporabnik lahko izbere rastline in ortologni tip, v odvisnosti od željene širine ortolognih skupin.

Takšne miRNA so evolucijsko ohranjene in nastanejo iz prepisa ortolognih genov, njihov razvoj je potekal skupaj s tarčnimi molekulami mRNA.

S tem smo dobili končno število vseh ortolognih genov med kvasovko in človekom, ki so vpleteni v metabolizem lipidov.

Razvrstitev genov v ortologne skupine je odvisna od nabora rastlin na katerem se izvede algoritem identifikacije ortolognih skupin.

Primerjava ortolognih zaporedij udomačenih genov kaže na visoko stopnjo ohranjenosti (pregl.

Primerjali smo ohranjenost ortolognih in paralognih zaporedij udomačenih genov pri sesalcih in drugih vretenčarjih.

Predvidevali smo, da se bo s povečevanjem števila dodanih genov in s tem širjenjem genske mreže, manjšalo število ortolognih genov.

Popravljanje teh obstoječih paralogov bi ob učenju odločitvenih dreves lahko rešili preko uporabe drugih algoritmov priprave ortolognih skupin za učno množico.

Odkritja pri modelnih organizmih lahko prenesemo na človeka in tako predpostavimo funkcijo ortolognih genov, kar olajša razumevanje in potencialno zdravljenje bolezni.

Objekt ortolognih skupin vsebuje vse skupine, ki imajo pet ali več zadetkov v obeh primerjavah.

Natančno prepoznavanje ortolognih segmentov je izjemno pomembno tudi v primerjalni genomiki.

Na podlagi ortolognih skupin s katerimi se povezujejo geni navadnega repnjakovca, smo omrežje nato prevedli na gene krompirja.

Med porazdelitvijo ortolognih skupin med predstavniki različnih vrst in filotipov ni bilo večjih razlik.

Krompir in paradižnik imata nižje vrednosti, saj sta evolucijsko bolj oddaljena, pa tudi nista vsebovana v vseh ortolognih skupkih.