sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "tal efektorja".
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Sklepamo, da vezava TAL efektorja prepreči dostop proteina dCas9 do zaporedja PAM, ki je v neposredni bližini vezavnega mesta za TAL efektor.
Uporabili smo različna razmerja 3'TAL efektorja in 5'TAL efektorja; 1 : 0,1 (a), 1 : 1 (b) in 1 : 10 (c).
Kovalentna fuzija TAL efektorja in domene VPR je izražanje povečala le okrog 250-krat (Slika 21).
TAL efektorja sta sestavljena iz N in C dela, ki predstavljata N-terminalni konec (N) in preostanek proteina (C).
DNA vezavno domeno (DVD) TAL efektorja TALE[A] oziroma protein dCas9 smo spojili z različnim številom ponovitev peptida P3.
Pripravili smo poročevalske plazmide z naraščujočo razdaljo med vezavnimi mesti za TAL efektorja TALE[A] in TALE[B] (Slika 38a-c).
Domena TAL efektorja , ki se veže na DNA vsebuje 1 - 35 TAL ponovitev .
TALE[B]-VPR aktivator sproži izražanje TAL efektorja TALE[D], ki izpodrine aktivator na poročevalskem plazmidu.
Ob dodatku TAL efektorja TALE[A], ta inhibira izražanje TAL efektorja TALE[D], kar pomeni, da se poročevalec lahko izraža (Slika 46a).
Slika 4: Shema 3D strukture kompleksa TAL efektorja in njegove tarčne DNA.
Slika 39: Oviranje vezave N-terminalnega konca 3'TAL efektorja s C-terminalnim koncem 5'TAL efektorja.
Prikazana je DNAvezavna domena TAL efektorja PthXo1, vezanega na DNA.
Kontrolni konstrukt TAL efektorja, kovalentno povezanega z domeno CIBN, je v tem primeru izkazal le okrog 2-kratno aktivacijo transkripcije, ne glede na aktivacijsko domeno.
Naši rezultati kažejo, da ob kotransfekciji TAL efektorja, ki se veže na prekrivajoče se tarčno zaporedje, lahko izredno učinkovito preprečimo cepitev s Cas9 endonukleazo.
Oba promotorja vsebujeta vezavna mesta za isti TAL aktivator, medtem ko vsak operon vsebuje 5' sosednja vezavna mesta za dva različna 5'tekmovalna TAL efektorja.
V vseh simulacijah je upoštevana začetna vezava 3'TAL efektorja (začetna koncentracija 1µM) na DNA (začetna koncentracija 10nM), 5'TAL efektor pa je v sistem dodan ob s prekinjeno črto označenih časovnih točkah.
Ob dodatku plazmida za izražanje TAL efektorja TALE[gfp] za vezavo na prekrivajoče se vezavno zaporedje v genu mCitrine, je intenziteta fluorescence ostala visoka (Slika 49b).
Ob vezavi TALE[AB]-VP16 transkripcijskega aktivatorja na sredinsko vezavno mesto pride do aktivacije transkripcije, v primeru prisotnosti 5' ali 3' tekmovalnega TAL efektorja pa smo pričakovali delno disociacijo aktivatorja in s tem nižje izražanje poročevalskega gena.
S premikom aktivacijske domene na TAL efektorja in dodatkom proteina dCas9 z gRNA nismo opazili inhibicije transkripcije (Slika 48c), kar nakazuje na učinkovitejšo vezavo TAL efektorjev.
Ta rezultat potrjuje, da tesna vezava C-terminalnega konca 5'TAL efektorja ovira vezavo N-terminalne domene 3'TAL efektorja, kar povzroči efekt usmerjenega izpodrivanja tako na prekrivajočih se kot tudi na sosednjih vezavnih mestih.