sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "mspi".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Lahko se uporabi tudi manj, 100 ng, vendar pa mora biti dovolj kvalitetna za čim bolj popolno razgradnjo z encimom MspI.
Kot najboljšo kombinacijo so prepoznali kombinacijo para začetnih oligonukleotidov 8f-926r in encima MspI s 686 pomnoženimi sekvencami in 221 unikatnimi 5' končnimi fragmenti.
Pri bogatosti 100 so se vse izkazale kot neučinkovite, še najbolje pa se je izkazala MspI z 58%.
Tudi dendrogram profilov TRFLP mikrobnih združb tal pripravljen s tretjim restrikcijskim encimom MspI (slika 10) kaže podobno sliko kot prejšnja dva.
Na podlagi preliminarne analize so v nadaljevanju celoten nabor vzorcev tretirali z encimoma PstI in MspI.
Iz meritev svetlobnega signala obeh reakcij se nato izračuna razmerje med reakcijama z encimoma HpaII/MspI.
Izstopajoč rezultat je predvsem delež vzorca HpaII-/MspI- pri 1. subkultivaciji, ki se zviša za skoraj 12 odstotnih točk.
Za vsak vzorec smo pripravili dve restrikcijski reakciji z različnima encimoma, HhaI in MspI.
Od teh štirih smo nato izbrali tri, BsuRI, HhaI in MspI, ki so po preliminarnih raziskavah omogočile nastanek najbolj pestrih profilov.
Za vsako restrikcijsko endonukleazo smo pripravili ustrezno reakcijsko mešanico, ki je vsebovala: 10 μL pomnožka PCR, 0,5 μL restrikcijske endonukleaze BsuRI ali MspI (konc.
Po končani inkubaciji smo restrikcijske mešanice z encimom MspI inaktivirali z 20-minutno inkubacijo pri 80 °C.
Ta sta bila pogojena z metilacijskim stanjem prepoznavnega mesta 5'-CCGG-3' in posledično z razrezom z HpaII ali MspI.
Vzorci s 5000 m nm so najbolj oddaljeni od ostalih vzorcev, pri cepitvi z MspI in HhaI je še posebej izstopal vzorec I/5000.
Pri cepitvah 240bp velikega produkta PCR je najbližje povprečju, cepitev z MspI s 93,1% skladnostjo (slika 28).
Poleg restrikcijske endonukleaze MspI so kot učinkovito izpostavili še endonukleazo HhaI.
Eksperiment 240bp_HhaI je najmanj skladen z ostalimi, najbližje je eksperimentu 240bp_MspI s 63,0% skladnostjo.
Tako smo dobili združene adapterje, ki se prilegajo obema mestoma restrikcije z EcoRI in HpaII/MspI.
Vsak vzorec je na vsakemu izmed markerjev vseboval dva informativna podatka pri vsaki od skupin razreza (EcoRI/HpaII in EcoRI/MspI).
Encima HpaII in MspI delujeta na enako nukleotidno zaporedje 5'-CCGG-3', ampak imata različno občutljivost na metilacijo.
Prvo mesto označuje pojavnost fragmenta pri razrezu z EcoRI/HpaII, medtem ko drugo mesto označuje pojavnost fragmenta pri EcoRI/MspI.