Znotraj bakterijske združbe nismo zaznali statistično značilnih razlik med obravnavami, smo jih pa opazili med prostorskima razdelkoma, t.j. koreninami in rizosfero.

Zadnji korak je najtežji, ker morajo rizobakterije uspešno kolonizirati rizosfero, da so učinkovite.

Za izboljšanje privzema nekatere vrste v rizosfero izločajo fitosiderofore, ki so sposobne kelacije kovinskih ionov.

Voda nato prihaja v stik z rizosfero, ki je sestavljena iz korenini s substratom in mikroorganizmi.

V začetnih razvojnih fazah rastlinskih sadik te v rizosfero sproščajo veliko sladkorjev.

V primeru daljših in močnejših padavin se lahko izpira v rizosfero.

V naravi se najpogosteje nahajajo na razkrajajočem rastlinskem materialu, običajno pa kolonizirajo rizosfero v tleh, ki so bogata z organsko snovjo.

Tako je uravnavanje vnosa soli regulirano že pri koreninskih epitelijskih celicah, ki aktivno vračajo odvečne ione v rizosfero.

Takim glivam, ki rastejo v obliki biofilmov pravimo, da so kompetentne na rizosfero.

Spore tvori v tleh, lahko kolonizira rastlinsko rizosfero in raste v stresnih razmerah.

S pojmom rudarjenje mineralnih hranil označujemo delovanje rastlin, ki kemijsko modificirajo rizosfero z namenom pridobitve mineralov, ki so vezani v drugih spojinah.

Rizobakterije so bakterije, ki lahko trajno poselijo korenine oz. tanek sloj okoli njih (rizosfero).

Rastline v rizosfero sproščajo flavonoide, ki se akumulirajo v njihovi okolici.

PGPR mora učinkovito kolonizirati rizosfero in se v njej tudi obdržati, da sploh lahko pozitivno vpliva na gostiteljsko rastlino.

P. oligandrum kolonizira rizosfero in koreninski sistem številnih vrst, hkrati pa lahko neposredno parazitira talne patogene.

Oboji so senzorji populacijske gostote, olajšajo komunikacijo med različnimi vrstami bakterij, ki kolonizirajo rizosfero.

Lahko naseljujejo rizosfero korenin rastlin, kjer so v sinergističnem medsebojnem odnosu.

Kovine se lahko spirajo iz substrata ali pa interagirajo z rizosfero in (mikro)organizmi v substratu.

Kot je že prej omenjeno, makrofiti sproščajo kisik iz korenin v rizosfero.

Korenine poleg kisika sproščajo v rizosfero tudi širok spekter drugih, večinoma organskih snovi.