Želiranje je ireverzibilen proces, pri katerem se vodikove vezi med polisaharidnimi molekulami pretrgajo, sproščena vezavna mesta pa zasedejo molekule vode.

Zaradi visoke vsebnosti vode so polimerne verige v hidrogelu dovolj gibljive in mobilne, da po pretrganju poiščejo nova vezavna mesta.

Zaradi tega njihova vezavna mesta niso znana, kljub temu da lahko eksperimentalno vemo, da se nanj vežejo molekule.

Za vsa tri omenjena vezavna mesta velja, da so glede na fizikalno-kemijske lastnosti mešanega značaja.

Vsebuje specifična vezavna mesta za začetne oligonukleotide (primerje) in edinstveno vezavno regijo za sondo, kar omogoča razlikovanje od virusne tarčne regije.

Vezavna mesta so ključna za samosestavljanje proteinskih struktur, pri čemer se za omogočanje interakcij med posameznimi enotami uporablja več pristopov.

V zadnji fazi se vezavna mesta ovrednotijo z različnimi kvantitativnimi parametri.

V primerjavi z nekovalentnimi zdravilnimi učinkovinami lahko kovalentne učinkovine ciljajo zahtevna (ang. undruggable) vezavna mesta.

V astrocitih in nevronih aktin vezavna domena vključuje vezavna mesta za aktin, tubulin, vimentin in najverjetneje tudi za sinemin.

Ugotovili bomo, katera vezavna mesta so značilna za substrate in katera za zaviralce ter preverili njihovo evolucijsko ohranjenost in fizikalno-kemijske lastnosti.

To nakazuje, da lahko mreže vodnih molekul izboljšajo vezavo ligandov v vezavna mesta proteinov.

To kaže na kompeticijo za vezavna mesta in posledičen antagonistični učinek privzema obeh kovin.

To je posledica zmanjšanja ionske moči, saj ioni manj tekmujejo za vezavna mesta na koloni.

Takšni skupki so manj obetavni kot potencialna vezavna mesta.

Snovi za zniževanje viskoznosti se vežejo na mAb in zasedajo vezavna mesta za proteine in posledično preprečijo medmolekulske interkacije.

Prisotnost drugih snovi: prisotnost drugih snovi lahko zmanjša adsorpcijo ciljnega adsorbata zaradi konkurence za vezavna mesta.

Pridobljena vezavna mesta smo v naslednjem koraku želeli združiti v skupke glede na njihovo podobnost.

Pri tem smo opazili, da se vezavna mesta zaviralcev in substratov v veliki meri prekrivajo.

Pri nizki gostoti nanosa je verjetnost vezave posameznih proteinov večja, saj so vezavna mesta manj nasičena.

Preostala nevezana vezavna mesta na površini se blokirajo z blokirnim pufrom, s čimer preprečimo nespecifično vezavo.