sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "vezavnega mesta".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Zelo pomemben parameter je tudi volumen (volume) vezavnega mesta, saj določa kakšne ligande lahko vezavni žep sprejme in kako jih veže.
Začetnim kovalentnim fragmentom določamo afiniteto do vezavnega mesta, pri čemer je lahko ta navidezno povečana zaradi visoke intrinzične reaktivnosti elektrofilne skupine.
Za vsak kompleks smo s programom cmcavity generirali datoteko vezavnega mesta s končnico as, ki jo potrebujemo za sidranje.
Za dodatno selektivnost vezave smo upoštevali tudi hidrofobni farmakoforni element, ki opisuje interakcijo s hidrofobnim žepom izven tarčnega vezavnega mesta.
Z izbiro štirih kristalnih struktur lahko tako identificiramo zaviralec neodvisno od tega, v kateri del vezavnega mesta se ta veže.
Večje število vezanj in razvezanj vodi v zmanjšanje intenzitete signalov protonov liganda, ki so v neposredni bližini vezavnega mesta.
Vezavno mesto je dovolj veliko za devet aminokislinskih ostankov, njihovo vezavo pa omogočajo trije do štirje aminokislinski ostanki vezavnega mesta.
Treba je izbrati tudi negativne kontrolne izbore, za katere smo prepričani, da ne tvorijo vezavnega mesta glede na kemijsko intuicijo.
Ti premiki lahko vplivajo na interakcijo med ligand in encimom tako, da spreminjajo konformacijo in fleksibilnost vezanega liganda ter prilagodljivost vezavnega mesta.
Tetrahidropiran je usmerjen izven vezavnega mesta in ne tvori interakcij z vezavnim mestom.
Te plasti zajemajo lokalne prostorske vzorce interakcij med okolico vezavnega mesta in že obstoječim delom liganda.
Ta premik sprosti dostop do alosteričnega vezavnega mesta, ki je v aktivnem stanju sicer prikrito.
Ta korak predstavlja nadgradnjo ter omogoča zanesljivejšo napoved potencialnega vezavnega mesta.
Stranske verige teh ostankov lahko zavzamejo različne konformacije, kar omogoča prilagoditev vezavnega mesta hidrofobnemu jedru steroidnega liganda in ga stabilizirajo znotraj receptorja.
Prva definira način iskanja vezavnega mesta, ki ga generiramo s programom cmcavity, druga pa protokol sidranja na vezavno mesto s programom cmdock.
Programi za sidranje lahko upoštevajo fleksibilnost liganda, vezavnega mesta ali fleksibilnosti obojega, čeprav je najpogosteje upoštevana le fleksibilnost liganda.
Primeri metod, ki temeljijo na strukturi tarče, so: molekulsko sidranje ter farmakoforni modeli, osnovani na strukturi vezavnega mesta.
Površine so delno transparentne, kar omogoča boljši vpogled v lego afitelesa in geometrijo vezavnega mesta.
Postopek lahko ponavljamo preko celotnega proteina in izostrimo položaj vezavnega mesta.
Poleg energetike smo obravnavali tudi mehaniko aminokislinskih ostankov vezavnega mesta in smo opazili, da se utrdijo ob vezavi zaviralca.