Tako so se stolpci z izrabljenim gojiščem producentskega seva in stolpci z izrabljenim gojiščem testerskega seva razlikovali le v koncentraciji prisotnega ComX.

Pri pridobivanju signalnega peptida ComX v našem primeru nismo dosegli tako visokega izkoristka, torej je še nekaj neizkoriščenih možnosti za povečanje donosa.

Poleg polimorfizma so pri sekvenciranju genov comQ, comX in comP ugotovili nižji delež parov GC kot pri esencialnih genih gyrA in rpoB.

Največkrat se signalni peptidi ComX med ferotipi razlikujejo v poziciji izoprenoidnega obroča zaradi različnih dolžin peptida, različna je lahko tudi posttranslacijska modifikacija.

V našem delu interakcij med signali nismo upoštevali, saj nam dodatne signalne molekule, ki bi vplivale na sintezo ComX, niso poznane.

Ugotoviti občutljivost bakterije na različne koncentracije signala ComX s spremljanjem aktivnosti promotorja surfaktinskega operona (srfA-lacZ) z merjenjem aktivnosti β-galaktozidaze.

Torej ComX sproži odziv surfaktinskega operona, kar je vidno kot povečanje števila celic v populaciji, ki svetijo z višjo jakostjo fluorescence.

Na njegovo sintezo pozitivno vplivata bakterijski ciklični lipopeptid surfaktin ter zunajcelični signal ComX, negativen vpliv na sintezo pa pripisujejo represorju sinR.

Kot odgovor na povečano celično gostoto bakterije producirajo signalne molekule, med katerimi sta najpomembnejša feromon ComX in stimulirajoči faktor kompetence (angl.

Frekvenca transformacije signalnih mutant bo ob dodatku signala ComX ne glede na tip mutacije v comQ podobna frekvenci transformacije divjega tipa.

V tem delu smo celični odziv merili kot aktivnost promotorja surfaktinskega operona (srfA-lacZ), ki se odzove na signal ComX.

S tem smo omogočili kopičenje višjih koncentracij molekule ComX v rastni komori, kar je vodilo v aktivnejše izražanje surfaktinskega operona.

Jakost fluorescence lahko izmerimo na fluorescenčnem mikročitalcu ali s pomočjo fluorescenčnega mikroskopa in ovrednotimo odziv glede na koncentracijo dodanega ComX.

Frekvenca transformacije signalne mutante z vstavljeno odpornostjo na kanamicin je ob dodatku ComX statistično višja kot frekvenca transformacije divjega tipa.

Avtorji so ugotovili, da tak sev, ki nosi v genu comQ zapis za odpornost proti kanamicinu postane preobčutljiv na ComX.

Signalna kaskada, ki vodi do sinteze surfaktina in posledično do formacije biofilma se prične s sintezo signalnega feromona ComX.

Prezračevanje smo izključili, saj smo ugotovili, da inhibira produkcijo ComX. pH nismo uravnavali in nismo dodali protipenilnih sredstev.