sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "farmakoforni".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Pogosto skupaj z
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Za virtualno rešetanje potrebujemo farmakoforni model ter knjižnico spojin med katerimi želimo iskati ali ustrezajo farmakofornemu modelu.
Za dodatno selektivnost vezave smo upoštevali tudi hidrofobni farmakoforni element, ki opisuje interakcijo s hidrofobnim žepom izven tarčnega vezavnega mesta.
Ugotovili smo, da imajo farmakoforni modeli, ki temeljijo na strukturi ligandov, za agoniste boljšo napovedno vrednost kakor tisti za antagoniste.
Tu poleg stabilnosti in interakcijskega vzorca protein-ligand uporabljamo tudi naprednejše metode proučevanja medmolekulskega prepoznavanja, kot so dinamični farmakoforni modeli.
Ti farmakoforni modeli nudijo le omejen vpogled v medmolekulsko prepoznavo med tarčno molekulo in ligandom, saj je vezava liganda dinamičen proces.
Tako lahko na osnovi strukture ligandov razvijemo farmakoforni model ali izvedemo iskanje po podobnosti.
Tako atome, ki tvorijo podobne interakcije, povežemo v farmakoforni element.
Ta vzorec smo opazili pri vseh prvih sto ligandih, za katere smo generirali farmakoforni model.
Statični farmakoforni model smo ovrednotili še s simulacijami molekulske dinamike, dinofornimi modeli in izračuni proste energije vezave.
Program na podlagi trening seta spojin generira farmakoforni model in ga primerja s testnim setom spojin.
Pripravljen farmakoforni model sestoji iz skupka v prostoru umeščenih farmakofornih elementov.
Primeri metod, ki temeljijo na strukturi tarče, so: molekulsko sidranje ter farmakoforni modeli, osnovani na strukturi vezavnega mesta.
Pri tej metodi se na podlagi znanih ligandov, ki se vežejo na tarčo, ustvari farmakoforni model.
Naši rezultati se skladajo z ugotovitvami študij, ki so preučevale kateri farmakoforni elementi so nujni za antiproliferativno delovanje zaviralcev.
Na osnovi teh spojin bomo generirali tridimenzionalni farmakoforni model na osnovi ligandov, ga validirali, in z njim rešetali našo interno knjižnico spojin.
Med slednje spadajo donorji in akceptorji vodikove vezi, hidrofobni farmakoforni elementi, farmakoforni elementi, ki opišejo aromatske interakcije itd.
Ko smo imeli objekte poravnane, smo uporabili funkcijo, ki nam je združila posamezne farmakoforne modele v en farmakoforni model (angl. merged pharmacofore).
Informacija o strukturi tarče omogoča, da izvedemo molekulsko sidranje ali prepoznamo pomembna mesta za interakcijo z ligandom in zasnujemo farmakoforni model.
Farmakoforni model se uporabi za virtualno rešetanje, da dobimo spojine, ki imajo željene farmakoforne elemente v specificirani razdalji.
Farmakoforni model opisuje prostorsko ureditev potencialnih interakcij, ki jih tvorijo ligandi z receptorjem.