V sklopu raziskave smo zbrali in navedli vse različice nukleotidnega zaporedja pri selekcioniranih linijah, ki ležijo v regijah s povišano vrednostjo GERP.

Vrednosti GERP obeh promotorskih različic sta zelo nizki glede na to, da je promotor zelo pomemben dejavnik pri regulaciji prepisa genov.

Trend je bil usmerjen v drug ekstrem, več kot tri četrtine različic leži na predelih zaporedja z negativno vrednostjo GERP.

Povišana vrednost GERP nakazuje, da se različice nahajajo v nadpovprečno evolucijsko ohranjenih regijah genoma miši, glede na pričakovano raven mutacij.

Postavili smo tri mejne vrednosti GERP in s tem pridobili tri skupine različic zaporedja, ki sovpadajo z evolucijsko ohranjenimi regijami.

Algoritmi za računanje vrednosti GERP lahko pokažejo nepravilne rezultate, posebej v primerih, ko se je tekom evolucije spremenila raven selekcije.

V prvo skupino (GERP > 1) smo zajeli vse različice, ki so prisotne v regijah s podpovprečno pojavnostjo mutacij v primerjavi s preostankom genoma.

Nobena od teh glede na lokacijo zanimivih različic ni dosegla niti prve meje (GERP = 1), ki bi nakazovala na njeno fenotipsko pomembnost.

Poleg oznake različice je zapisano število genomov živalskih vrst, kateri so bili uporabljeni v poravnavi za izračun vrednosti GERP.

Odkrite različice smo razdelili glede na lokacijo v zaporedju, prisotnost v poznanih regulatornih regijah in glede na vrednost GERP.

A v genomu človeka najdemo tudi zelo kratke elemente z visoko vrednostjo GERP ter dolge elemente z nizkimi vrednostmi.

Izkazalo se je, da to ni mogoče, saj med odkritimi različicami nismo zasledili takšne, ki bi imela vrednost GERP višjo od 4.

Načrtovali smo še nadaljnjo filtriranje rezultatov do mejne GERP vrednosti 4, kjer bi raven lažno pozitivne detekcije padla pod deset odstotkov.

Višja GERP ocena označuje močnejši evolucijski pritisk za ohranjanje določene sekvence, kar pogosto kaže na njeno funkcionalno pomembnost.

Ohranjenost regij ocenimo s pomočjo vrednosti GERP, ki nakazuje na nižjo raven nukleotidnih zamenjav v tem predelu genoma.

Poleg oznake različice je zapisano število genomov izbranih živalskih vrst uporabljenih v poravnavi za izračun vrednosti GERP.

Za razliko od preostalih vrednost GERP prezre vpliv vrzeli v zaporedjih, ki jih med sabo primerja.

Višja vrednost GERP pomeni zmanjšano število substitucij na opazovanem predelu genoma, v primerjavi s pričakovano vrednostjo.

Stolpično so prikazane povprečne dolžine in vrednosti GERP za vsak izbrani gen pri posamezni živalski vrsti.