sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "phred".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Večina programov določi vsakemu odčitku phred vrednost kakovosti kartiranja.
Phred 33 je namreč logaritemska vrednost možnosti napak pri identifikaciji sekvenciranega nukleotidnega zaporedja, zapisana v obliki celih števil (običajno z vrednostmi med 0 in 40).
Najprej se odčitki filtrirajo glede na kvaliteto (vrednost phred33).
Na koncu smo izločili vse sekvence, ki niso vsebovale vsaj 250 baz s kvaliteto nad phred 20.
Vrednost Phred se je po odstranitvi vmesnikov zvečala, saj so imeli konci zaporedij večjo verjetnost, da je bil nukleotid napačno sekvenciran.
C-ocena je logaritmična (PHRED-like) in nanjo vpliva tudi njena ocena patogenosti v primerjavi z drugimi možnimi spremembami na nukleotidu.
Nizke Phred ocene kakovosti lahko povečajo možnost lažno pozitivnih klicev baz, kar privede do netočnih zaključkov in višjih stroškov za validacijski eksperiment (44).
Vrednost "Phred" na osi x, predstavlja stopnjo zaupanja, da je bila baza pri sekveniranju pravilno prebrana.
Gre za 291 nukleotidov dolge odčitke v formatu fastq, ki vključuje tudi oznako za kakovost sekvenciranja posamezne baze z oceno Phred.
Istega leta je bil pri PhRED posnet kratki film z enakim naslovom po njenem scenariju.
Slika 4 prikazuje povprečne vrednosti Phred, ki se glede na pozicijo baze pri odčitkih niso drastično razlikovale.
Vrednosti Phred pod 20 nakazujejo na nizko kakovost sekvenc, le-teh je bilo v naši analizi zanemarljivo malo.
Četrta vrstica vsebuje vrednosti ocene kakovosti ali Phred score za vsak nukleotid v sekvenci.
Del odčitka, kjer ocena Phred pade pod arbitrarno določeno pražno mejo imenujemo nekvaliteten konec.
Slika 7 kaže, da je zelo majhno število odčitkov s kakovostjo nižjo od 27 in da je največ odčitkov s povprečno vrednostjo Phred 36.
Predstavi se v obliki Phred kakovostne ocene, ki je negativni logaritem verjetnosti napake.
Kot smo predpostavili, je ocena kakovosti Phred pri sekvenciranju dolgih odčitkov dosti nižja.
Po podatkih raziskav se moramo zavedati, da sekvenciranje dolgih fragmentov ne sledi oceni kakovosti Phred (69).
Le nekaj sekvenc se nahaja v rumenem delu grafa, kar nakazuje na zmerno kakovost sekvenc (Phred med 20 in 30).
Začetna analiza pridobljenih zaporedij formata .pdf je pokazala, da je večina nukleotidov imela Phred vrednosti med 20 in 30.