Zaradi nezmožnosti vezave začetnih nukleotidov ne pride do pomnoževanja mikrosatelita, kar nam lahko da lažno predstavo o neobstoju mikrosatelita oz. njegovi smrti.

V tej fazi smo lahko le potrdili primernost izbranih začetnih oligonukleotidov in uspešnost pomnožitve mikrosatelita.

V ostalih primerih je šlo le za spremembo v eni ponovitvi mikrosatelita.

V obdajajočih regijah mikrosatelita pride do mutacij, kot so insercije, delecije ali substitucije.

V bližini genov na nekaterih kontigih nismo našli nobenega mikrosatelita.

Tretja možnost pa bi bila razširitev iskanja na začetnik skupaj z bočno regijo in morda še delom mikrosatelita s ponavljajočim se motivom.

Ti fragmenti se razlikujejo v številu ponovitev osnovne enote mikrosatelita.

Sekvence v podatkih so sestavljene iz sprednje in zadnje oznake, sprednjega in zadnjega oligonukleotidnega začetnika in mikrosatelita s svojimi bočnimi regijami.

Rodič, je izpostavil predvsem problem virov sredstev za izstrelitev mikrosatelita (zgrajen v okviru centra odličnosti), ki so preveč razpršena.

Pri določanju alelov se morata pravi alel in njegov zdrs ujemati v celotni sekvenci, razen v številu ponovitev motiva mikrosatelita.

Preverimo še vpliv lokusa oziroma sekvence mikrosatelita na razporeditev.

Predvidevali smo, da zaporedna uporaba starter kulture in spremembe v številu ponovitev osnovne enote mikrosatelita vplivajo na izražanje genov.

Posledica lažne smrti mikrosatelita so številni na videz neuspeli poskusi pomnoževanja lokusov med vrstami.

Pogledamo lahko še, ali sekvenca mikrosatelita oziroma lokus vpliva na končni rezultat.

Nestabilnost mikrosatelita se poveča, ko pride do mutacije ali okvare genov, ki so odgovorni za popravljalni mehanizem.

Možno je, da je prišlo znotraj takšnih sevov do propada določenega mikrosatelita.

Morda pa ima tudi tu lahko vpliv sekvenca mikrosatelita.

Medtem ko pri koruzi in ananasu poročajo o prekinitvah mikrosatelitov zaradi indel mutacij, ki so vplivale na skrajšanje mikrosatelita.

Med podvajanjem mikrosatelita lahko zaradi homologije zaporedij pride do začasne disociacije verig matrične in nastajajoče verige, kar privede do nastanka zanke.

Ironično oz znižanjem cene na kg bomo lahko imeli startupe za najem teleskopov v obliki mikrosatelita.