sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "pdb id".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Pogosto skupaj z
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
PDB ID), ime izhajajočega organizma, vrednost ločljivosti in vrsto metode pridobivanja kristalne strukture ter nazive pripadajočih ligandov.
Vsak strežnik nam je v obliki PDB ID posredoval informacije o strukturah molekul, ki jih je izbral kot šablone za modeliranje.
Izvedli smo ukaza run align_all_to_all.py in align_all_to_all object_list=spisek PDB ID, full_matrix=1.
Nato je strežnik zahteval podatek o PDB ID-kodi proteina ali lastno datoteko v obliki .pdb.
PDB ID-ji šablon so našteti v preglednici 9.
Rdeča barva označuje vodikovo vez, zelena hidrofobne interakcije, rumena pa kombinacijo hidrofobnih interakcij in vodikove vezi (PDB ID: 6PUW).
Rdeča barva označuje vodikovo vez, zelena hidrofobne interakcije ter rumena kombinacijo hidrofobnih interakcij in vodikove vezi (PDB ID: 1KLM).
Iz zadetkov smo najprej izločili podvojene vnose glede na PDB ID proteinov.
Vsak vnos strukture v podatkovni bazi je opremljen s štirimestno identifikacijsko kodo - PDB ID (19,20).
Iskanje v bazi je mogoče s PDB ID-jem, sekvencami in imeni makromolekul ter SMILES zapisi ligandov.
Fosfoholinske molekule ( označene s številkami 1 – 3 ) se prekrivajo s topno lizeninsko strukturo PDB - ID 3ZX7 in so prikazane kot krogle .
Sekundarna struktura encima je predstavljena z rumeno barvo (PDB ID: 4PK6), hem z oranžno in spojini z zeleno.
Tem smo v zbirki UniProtKB poiskali oznake UniProt, nato pa s pomočjo teh poiskali PDB ID proteinov, če so bili na voljo.
Pri tem smo si pomagali s PDBe, v katerem smo v iskalno okno vpisali PDB ID, pri tem pa dobili oznake UniProt.
Pridobili smo seznam 64 proteinov, za katere smo s pomočjo podatkovne baze RCSB PDB na podlagi njihovih PDB ID-oznak preverili izhajajoče organizme.
Vsem napovedanim tarčam smo določili PDB ID in verigo proteina.
Vsaki napovedani tarči smo določili PDB ID in verigo proteina.
Fetch PDB ID), iz vseh encimov smo odstranili vse verige, razen verige A z ukazom: ne izberi verige A (ang.
Ta nam omogoča, da vtipkamo željen PDB ID in tako prikažemo interaktivno 3D strukturo molekule.
V prvo polje smo vnesli PDB ID posameznega govejega proteina, v drugo polje pa PDB ID navzkrižno reaktivnih partnerjev.