sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "cazy".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
CAZY-mi te skupine prevotel so popolnoma usmerjeni v razgradnjo rastlinskih polisaharidov kot so ksilan in druge hemiceluloze, pektin in škrob.
CAZY-me smo v genomih poiskali z modeli proteinskih profilov dbCAN.
NMDS profile CAZY posameznih bakterij prikaže kot točke na koordinatnem sistemu - bolj podobne so si bližje, manj podobne pa so bolj narazen.
Od takrat se je z odkrivanjem novih glikoziltransferaz to število še dodatno povečevalo, tako jih danes v bazi podatkov CAZy (ang.
Z rdečo zvezdico so označene tiste kategorije po CAZy podatkovni bazi, ki kažejo statistično značilno razliko od kategorij ostalih gliv.
Z barvami so označene skupine bakterij, ki smo jih glede na graf določili kot skupine s podobnim profilom encimov CAZY.
V genomih obeh bakterij smo poiskali encime CAZY, nabor teh encimov pa smo primerjali z nabori encimov drugih morskih bakteroidet.
Iz števila značilnih CAZy za posamezni substrat smo napovedali, ali le-tega posamezna bakterijska vrsta/sev domnevno razgrajuje ali ne.
Dopisani so tudi substrati, ki jih vrsta/sev domnevno razgrajuje (predvidene substratne specifičnosti so oblikovane glede na število specifičnih CAZy).
Predpostavili smo, da bakterije, ki imajo večje število zapisov za posamezne monospecifične oz. značilne CAZy, ta substrat lahko razgrajujejo.
Poleg tega smo preučili družine CAZy, ki niso nujno monospecifične, a so eksperimentalno potrjeno vpletene v razgradnjo določenih substratov.
Dopisani so tudi substrati, ki jih sev domnevno razgrajuje (predvidene substratne specifičnosti so oblikovane glede na število specifičnih CAZy).
Želeli smo preučiti, če se nabor zapisov za CAZy dejansko odraža v substratni specifičnosti (specializiranosti) bakterijskih sevov/vrst.
Posodobljeni podatki o lastnostih in klasifikaciji encimov identificiranih glikozid hidrolaz so na voljo v podatkovni bazi CAZy (angl.
Ker so družine CAZY redko substratno specifične, sama uvrstitev v družino ne pomeni nujno tudi ugotovitve funkcije proteina.
Z metodo nemetričnega večrazsežnostnega lestvičenja smo vizualno predstavili korelacijo med profili CAZy pri bakterijah, zajetih v analizi.
V dobro preučenih monofiletskih linijah običajno prevladuje en tip prehranjevanja, genomi pa vsebujejo podobno število CAZY-mov.
Tisti sevi, ki imajo podobne profile CAZy, so na dendrogramu bližje skupaj oz. so v istem skupku.
Sevi, ki imajo podoben profil CAZy, so v istem skupku oz. so umeščeni bližje skupaj na dendrogramu.
Pripravili smo datoteko skupaj.csv, v kateri so zapisana števila predstavnikov družin CAZY v genomu vsake bakterije.