sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "charmm".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
CHARMM se uporablja predvsem za študij bioloških sistemov, široko ga uporabljajo tudi za študije pri oblikovanju novih materialov z želenimi lastnostmi.
CHARMM pa vsebuje tudi metodo ABNR, ki je izpeljana iz gradientnega spusta in vsebuje dodatne funkcije za premagovanje ovir lokalnih minimumov.
S pomočjo programa CHARMM smo izvedli postopek, pri katerem smo približali reaktivne atome tako blizu, da je nastala kovalentna vez.
LPO program doloci priblizno prostorsko strukturo molekule , ki ji potem specializiran program CHARMM doloci dejansko strukturo .
Kasneje so razvili vplivno računalniško orodje CHARMM za molekularno dinamiko in študirali vedenje različnih beljakovin.
Za stereokemične omejitve, ki določajo dolžino vezi in kot vezi pa pridobi podatke z uporabo polja sil Charmm-22.
CHARMM in GROMOS pa sta bila originalno razvita za simulacije manjših molekul.
RMSD ter pregledu literature ugotovili , da CHARMM 27 ni primerno polje sil za preučevanje kvadrupleksov .
Uporabili smo polje sil CHARMM36 (81), ki je vključevalo ustrezne parametre polja sil tudi za sladkorne ligande.
Kontakte med aminokislinskimi ostanki proteina in membrano smo izračunali s programskim paketom CHARMM [92].
Po končanih simulacijah molekularne dinamike smo pripravili dve CHARMM ukazni datoteki.
Uporabili smo polje sil CHARMM 36, ki vsebuje parametre za proteine in za razliko od starejših verzij CHARMM, tudi podatke za lipide.
CHARMM je prosto dostopen računalniški program (CHARMM, brez datuma).
Za simulacije molekulske dinamike smo uporabljali program CHARMM v akademskih različicah 37, 39 in 40.
Slednji je nato bil optimiziran tudi za amino kisline in peptide, CHARMM pa še za maščobe in DNA [28].
Replica path metoda je del programskega kompleta CHARMM.
Martin Karplus je glavni avtor programskega paketa Charmm , ki me je popeljal v svet molekulskih simulacij .
Opravili smo tudi simulacijo 1 KF1 s poljem sil CHARMM 27 , vendar smo pri analizi rezultatov , predvsem stabilnosti strukture oz.
Nadaljnje simulacije reakcijskih mehanizmov so potekale s pomočjo prej opisanega programa CHARMM in programa GAMESS.
Metodi sta implementirani v programih GAMESS20 in CHARMM6, ki sta povezana v eno funkcijsko enoto.