sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "cytoscape".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Pogosto skupaj z
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Zato smo omrežje ekstrahirali v programu cytoscape in ustvarili .xgmml datoteko na kateri smo izvedli ekstrakcijo koordinat.
Cytoscape dopušča možnost uporabe drugih programov, kot je npr.
Cytoscape - programsko orodje je odprtokodno programsko orodje , ki ga še zlasti zelo uporabljajo na področju bioinformatike , natančneje pri analizi in vizualizaciji biološkihomrežij .
Datoteke , ki smo jih uporabili za obdelavo v ggobi programu , lahko uvozimo tudi v program cytoscape .
Na sliki 29 vidimo vnosno okno programa cytoscape , na katerem izberemo parametre za vnos podatkov .
Zbirko linearnih poti smo nato obdelali še s skriptami, katere je za namen lažjega prenosa nazaj v vizualizacijski program Cytoscape pripravila dr.
Te smo našteli v preglednici, razvrstili po verjetnosti vezave, jim dodali simbole njihovih genov in verjetnost vezave grafično vizualizirali v programu Cytoscape.
Ker Cytoscape ne omogoča shranjevanja koordinat vozlišč, smo urejenim omrežjem pripisali še vrednosti koordinat (x,y), da se želena postavitev omrežja shrani.
Z uporabo programa Cytoscape smo pripravili omrežje, ki prikazuje različne funkcionalne skupine, znotraj katerih so razporejene biološke kategorije (obogateni seti proteinov).
Prvotno je bil Cytoscape osnovan za biološke raziskave, zdaj pa se uporablja kot splošna platforma za kompleksno analizo in vizualizacijo omrežij.
Ob uvozu mreže v Cytoscape smo najprej izvedli diskretno obarvanje proteinov (vozlišč) glede na njihovo vpletenost v različne progeroidne sindrome.
Programsko opremo Cytoscape ( / / www.cytoscape.org/ ) smo uporabili za predstavitev mreže za ekspresijo genov lncRNA in mrežo bioloških procesov lncRNA .
Ugotovili smo, da je do tega prišlo zaradi določenih parametrov, po katerih smo reducirali omrežje v vizualizacijskem programu Cytoscape.
V preglednici so naštete vse pomembne miRNA/miRNA z največ povezavami, ki so rezultat analize z orodjem Cytoscape.
Najboljših predvidenih sto zadetkov sidranja smo prikazali v preglednici 3 in vizualizirali po verjetnosti vezave v programu Cytoscape, na sliki 10.
Tekom filtriranja omrežja v programu Cytoscape smo odstranili vsa vozlišča, ki niso vodila do patologije.
Nato smo z orodjem Cytoscape izrisali interaktom, ga analizirali ter vstavili preglednico eksperimentalno potrjenih interakcij.
Interaktivna oblika modela , ki se ga lahko odpre s programom Cytoscape , je na voljo tukaj .
Z uporabo orodij, kot je Cytoscape, raziskovalci vizualizirajo kompleksne povezave v dramskih delih ali korespondencah.
Rezultati analize obogatitve so predstavljeni v preglednici ter z grafikami, ustvarjenimi v programu Cytoscape.