sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "fastqc".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Po končanem delu dobimo rezultate v obliki hipertekstovne datoteke fastqc_report.html, kjer jih lahko pregledamo.
Orodje poženemo tako, da ga prenesemo na računalnik, ga odpremo in zaženemo run_fastqc.bat.
Nato smo z ukazom fastqc preverili kakovost nukleotidnih zaporedij za vseh osem setov sekvenčnih podatkov.
FastQC orodje nam omogoča opredelitev kakovosti podatkov prebranih baz vsakega odčitka.
FastQC je program za analizo surovih sekvenčnih podatkov, pridobljenih s tehnologijami, ki proizvedejo kratke odčitke.
FASTQC nam vrne poročilo kakovosti , na osnovi katerega nastavimo parametre za rezanje oz. krajšanje sekvenc .
Pridobljenim sekvenčnim podatkom smo preverili kakovost prebranih zaporedij s programskim orodjem fastqc (verzija 0.11.8) in odstranili adaptorska zaporedja v določenih nukleotidnih zaporedjih.
Da bi omogočili neposredno primerjavo kakovosti pred in po obrezovanju, smo isti postopek ponovili tudi za poročila FastQC, ustvarjena po obrezovanju sekvenc.
Za tem smo ponovno uporabili FastQC za preverjanje kakovosti očiščenih podatkov in s tem potrdili, da smo odstranili odčitke nizkih kakovosti.
Cilj programa FastQC je zagotoviti preprost način za kontrolo kakovosti surovih podatkov zaporedij, pridobljenih iz visoko zmogljivih sistemov določevanja zaporedij.
Pred kartiranjem kratkih odčitkov je treba preveriti njihovo kakovost in prisotnost morebitnih adapterskih sekvenc, kar naredimo s programom FastQC.
FastQC omogoča hitro vizualno oceno kakovosti branj, kar vključuje preverjanje kakovostnih ocen baz, vsebnosti GC, in prisotnosti adapterjev.
Orodje FastQC nam generira poročilo o kvaliteti prejetih sekvenc in je danes že običajen korak analiz visokoprepustnega sekveniranja .
V kontekstu poročil FastQC pred obrezovanjem, lahko prekomerno zastopani k-meri kažejo na aberacije v sekvenciranju.
Drugi način pa je namenjen veliki količini podatkov in se običajno izvaja na strežnikih kot del programskega cevovoda ( ang. pipeline ) ( FASTQC , 2010 ) .
Na podlagi rezultatov iz programa FastQC, smo se odločili za krajšanje in dodatno preverjanje odčitkov.
S pritiskom na najdeno povezavo si je možno ogledati FastQC-poročilo v novem zavihku.
Vsa poročila programa FastQC smo skopirali v direktorij imenovan multiqc preko ukaza "cp".
Slednje je pričakovano in ne predstavlja težave pri nadaljnjih analizah (FastQC ..., b. l.).
FastQC prav tako izvede analizo prisotnosti adapterskih sekvenc, prekomerno zastopanih sekvenc in stopnje duplikacije (Andrews in sod., 2010).