sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "autodock".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Pogosto skupaj z
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Ko ga das v dock se telefon polni , avtomatsko zazene kar pac nastavis , v tem primeru autodock app .
Ko ga das v dock se telefon polni, avtomatsko zazene kar pac nastavis, v tem primeru autodock app.
Za virtualno rešetanje sta uporabila računalniški program AutoDock 4.0, postopek pa je podrobneje opisan v poglavju 3.4.
Med bolj široko uporabljenimi programi, ki uporabljajo tovrsten način, je AutoDock.
Kljub izboljševanju strukture pa program AutoDock ni dal zelo dobrih rezultatov.
Za testirane komplekse 1-8 smo za zaviranje AChE izvedli tudi molekulsko sidranje z računalniškim programom AutoDock v sodelovanju s prof. dr.
AutoDock za boljši opis neveznih interakcij uporablja tudi funkcije, ki upoštevajo vpliv vodikovih vezi (10-12 Lennard-Jonesov potencial), solvatacijo in entropijske prispevke.
S pomočjo AutoDock Vina so določili, kakšna mora biti konformacija jedrnih receptorjev, da dosežemo optimalno vezavno ligandov.
Z metodo AutoDock Vina 1.1 smo pridobili najslabše rezultate, saj je program največ spojin sidral izven vezavnega mesta.
Ostale interakcije so bile podobne kot pri metodi AutoDock 4.2.
Izbrane najboljše spojine vsakega posameznega umeščanja, smo nato še enkrat preverili s programom AutoDock Vina.
Zgornjih 10 % spojin glede na parametre ugodnosti vezave smo nato preverili še s programom AutoDock Vina.
Večina programov upošteva samo fleksibilnost liganda (semifleksibilno sidranje), nekaj pa jih tudi delno upošteva fleksibilnost proteina (Autodock 4.0, FlexE in GOLD).
Z uporabo algoritmov za sidranje (Maestro, Autodock VINA) bomo analizirali energije vezave izomerov citidin-5'-monofosfata in fenil substituiranih tetraoksanov.
Zato bo potrebno najprej opraviti validacijo sidranja in ugotoviti, kateri izmed računalniških programov (Autodock 4.2, AutodockVina in Glide) je najustreznejši.
Metoda AutoDock Vina 1.1 spojine ni umestila v vezavno mesto, saj na spodnji sliki vidimo, da je izven vezavnega mesta (Slika 20).
Umestitev z Autodock vina 1.2 smo opravili, tako da smo inhibitorje (AD-4, DTP-036), 1-acenaftol in progesteron umestili v popolnoma rigidno proteinsko molekulo.
Slednje smo izvedli z iskalnim algoritmom AutoDock Vina, rezultate molekulskega sidranja pa smo analizirali s programom Chimera.
Vse spojine bomo računalniško pripravili v trodimenzionalni obliki v ChemBio 3D in z njimi opravili virtualno rešetanje s programom AutoDock in AutoDockVina.
Molekulsko sidranje izbranih proučevanih smo izvedli s pomočjo programske opreme AutoDock Vina preko vmesnika programa LS.