sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "msfragger".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Pogosto skupaj z
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
MSFragger omogoča različne nastavitve, ki jih lahko uporabimo za iskanje peptidov.
MSFragger in MetaMorpheus imata enako nastavitev števila uporabljenih niti, in privzeto uporabita eno manj od maksimalno razpoložljivih procesorskih jeder v računalniku.
Poleg tega MSFragger ustvari fragmentni indeks, kjer so teoretični fragmenti povezani s starševskim peptidom in razporejeni v masne razdelke.
Avtorji so ugotovili, da je MSFragger bil najboljši od vseh analiziranih programov v dveh od treh primerov analiziranih proteomskih podatkov [30].
V najmanj primerih ni identificiral določenega peptida program MSFragger, ko so ga identificirali ostali trije programi.
MSFragger za iskanje podatkov ne sprejme datoteke FASTA, če ta nima dodanih lažnih (angl. decoy) zapisov.
Opisane so spremenljivke izhodnih datotek in različne možnosti uporabe in iskanja peptidov s programom MSFragger.
To pomeni, da je imel program MSFragger najboljše prekrivanje z identificiranimi peptidi ostalih programov.
V podatkih MSFragger-ja smo združili podatke o mapiranih proteinih za posamezno vrstico.
Program MSFragger temelji na inovativnem pristopu indeksiranja fragmentnih ionov (angl. fragment-ion indexing).
Najmanjkrat nemodificiranega peptida ni našel MSFragger, ko so ga identificirali ostali trije programi.
Program MSFragger je orodje, ki se uporablja za identifikacijo peptidov v proteomiki.
Program MSFragger je identificiral peptid, ki vsebuje krajši peptid znotraj tega peptida.
Iz preglednice 8 ugotovimo, da je največ modificiranih in nemodificiranih peptidov identificiral program MSFragger, tj. 781 modificiranih in 2258 nemodificiranih peptidov.
Program MSFragger je lahko nekoliko počasnejši zaradi uporabe fragment-ion indexing.
Največ modificiranih in nemodificiranih peptidov je našel program MSFragger.
Pri programih MSFragger in AlphaPept smo morali te podatke vnesti ročno, saj privzeto ponujata le osnovne modifikacije.
Pri primerjavi časa analize je imel program MetaMoprheus najkrajši čas analize, sledil pa mu je program MSFragger.
MSFragger je edini program, ki ni identificiral najdenih peptidov v datoteki 35_PR150.
Najbolje je peptide po ključu identificiral program MSFragger.