sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "blastx".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Pogosto skupaj z
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Pridobljeno zaporedje smo vnesli v orodje "blastx" in z iskanjem najbolj sorodnih zaporedij nukleotidov identificirali gen.
Pri tem smo uporabili algoritem blastx, v primeru, ko ni bilo zadetkov za dano sosesko, pa smo pognali še algoritem blastn.
Ustreznost konstruktov po sekvenciranju smo preverili s spletnim programom blastx116.
Osnova je poravnava virusnih sosesk, ki so bile z analizo BLASTx najbolj podobne ʺDiabrotica undecimpunctata virus 2ʺ ter njihovih najbolj sorodnih zaporedij.
Zato povratno preverjanje klik z globalno poravnavo na grafu zgrajenem z BLASTx-om, ne moremo uporabiti za ocenjevanje pravilnosti rezultata.
Tudi večina sosesk pri kliki velikosti 3 (slika 24) je popolnoma neskladnih, kar lahko pojasnimo z delovanjem algoritma BLASTx, ki je namenjen lokalni poravnavi.
Z analizo BLASTx smo za preučevana virusna zaporedja pridobili najboljša ujemanja, ki so deponirana v podatkovnih bazah.
Sequence comparison of the reduced set follows with an appropriate sequence comparison algorithm (BLASTx in our case).
There is an edge between two contigs if BLASTx aligned them with the same sequence.
Rezultati analize BLASTx so pokazali, da večina teh zaporedij najverjetneje v resnici pripada bakterijskim vrstam.
Za daljše soseske smo z uporabo orodja BLASTx določili identiteto z znanimi virusnimi zaporedji.
Vsak rezultat BLASTx je bil pretvorjen v neusmerjeno povezavo med zaporedjem sonde in tarče.
Vsak zadetek BLASTx iz seznama naših kombinacij je dobil razredni atribut 'je ortolog'.
Sledi primerjava zaporedij zmanjšanih množic zaporedij med skupinama s primernim algoritmom (algoritem BLASTx).
Soseski sta povezani, če jih je BLASTx poravnal z isto znano sekvenco. . . . . . . . . . . . .
S programom BLASTX smo ugotovili, da se na plazmidu nahaja replikacijska regija.
Na plazmidu pES6 smo s programom BLASTX določili 68 kodirajočih regij, od tega jih ima 43 opredeljeno določeno funkcijo.
Identiteta z znanimi virusnimi zaporedji je bila dodatno določena s primerjavo zaporedij proti podatkovni bazi nr proteinskih zaporedij z uporabo NCBI BLASTx.
Celotna zaporedja amplikona hmelja, uporabljena za izdelavo oligonukleotidnih začetnikov smo poravnali z NCBI podatkovno zbirko na proteinskem nivoju s spletnim orodjem BLASTX.
BLASTx poizvedba (angl. query) z NCBI nr podatkovno bazo je pokazala, da 106.798 zaporedij (71 %) ni imelo nobenega proteinskega zadetka.