sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "blastp".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Pogosto skupaj z
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
BLASTp primerja aminokislinsko zaporedje s podatkovno zbirko o zaporedjih aminokislin in išče območja podobnosti.
S programskim orodjem BLASTp omenjene insercije nismo našli v nobenem izmed aminokislinskih zaporedij subtilizinu podobnih proteaz, ki so že bile proučene.
Za identifikacijo homolognih encimov, potencialno vključenih v razgradnjo plastike, smo izvedli BLASTp analizo z uporabo referenčnih sekvenc potrjenih encimov.
Še več , BLASTP izvaja iskanje razmerja med beljakovinami in primerjavo , njegova formula pa se uporablja za različne druge raziskave .
Roary kot odgovor na to vprašanje uporabniku omogoči nastavitev najmanjšega deleža identičnih aminokislin za algoritem BLASTp.
Iz nadaljnje analize smo izločili tudi zaporedja, ki jih algoritem BlastP ni prepoznal kot preiskovane označevalce.
Za pomoč pri interpretaciji rezultatov pridobljenih z orodjem BLASTp smo vizualizirali sorodnost med analiziranimi bakterijami.
Preliminarni pregled prisotnosti genov (preglednica 18) preko predstavnikov genomskih skupin z BLASTp (3.1.4.3) nam je omogočil selekcijo genov za nadaljnjo konstrukcijo začetnih oligonukleotidov.
BLASTP analiza je s primerjavo aminokislinskega zaporedja homocistein metiltransferaze iz S. erythraea.
BLASTP analiza tega zaporedja z genomom S. erythraea je prikazala dva zadetka s stopnjo identičnosti 75 in 71 %.
Pri tem smo v nastavitvah uporabili algoritem blastp (protein-protein BLAST) in zadetke iskali znotraj podatkovne baze ˝Non-redundant protein sequences (nr)˝.
Za določitev podobnosti primarnih struktur smo v orodje BLASTp vpisali UniProt oznaki obeh proteinov in kot rezultat uporabili % podobnosti (% id).
Orodje BLASTp je namenjeno iskanju lokalnih ujemanj med aminokislinskimi zaporedji.
Iskanje z BLASTp pa je razkrilo nekaj homologije z genskimi produkti, povezanimi s profagi, kodiranimi v genomih znotraj reda Bacteroidales.
Z orodjem BLASTp smo primerjali primarne podobnosti parov proteinov na podlagi njihovih oznak UniProt ter rezultate izrazili kot % id.
V nepresežni zbirki proteinov preiskani z blastp se zaporedje ne ujema z nobenim proteinom, ki vsebuje domeno MACPF/CDC.
Aminokislinsko zaporedje smo anotirali z več spletnimi orodji: dbCAN (angl. database for automated carbohydrate-active enzyme annotation) (Zhang in sod., 2018), BlastP (angl.
Za primerjavo primarnih struktur proteinov se uporablja BLASTp (angl.
Po analizi z algoritmom PHASTER smo za vsako predvideno regijo genoma bakteriofaga z algoritmom Blastp preverili anotacije proteinov.
Analiza BLASTp proteina OxyM je pokazala, da spada v družino kratkoverižnih dehidrogenaz/reduktaz (angl. short chain dehydrogenase/reductase).