sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "blastn".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Z namenom anotacije zaporedij smo z algoritmom blastn poiskali njihove ortologe pri govedu in človeku z najvišjo oceno identitete.
Te skupine imajo namreč blastn rezultate precej nizke in zelo podobne odstotke podobnosti s številnimi gojenimi sevi.
Pri tem smo uporabili algoritem blastx, v primeru, ko ni bilo zadetkov za dano sosesko, pa smo pognali še algoritem blastn.
Iskanje z algoritmom blastn pokaže podobnosti samo določenih fragmentov genov.
BLASTn smo uporabili, da smo izključili mutacije, pri katerih se premakne bralni okvir.
BlastN deluje po načelu iskanja lokalnih podobnosti in pri izračunu podobnosti upošteva le primerjane odseke sekvenc .
Visok % identičnosti (> 90 %) med zgoraj omenjenimi geni smo zaznali tudi s spletnim orodjem blastn, med pripravo specifičnih začetnih oligonukleotidov.
Orodje BLASTn omogoča primerjavo dobljene sekvence z že znanimi sekvencami iz baze podatkov in določi, za katero vrsto organizma gre.
V privzetih nastavitvah BLASTN algoritma smo naše nukleotidno zaporedje primerjali z nukleotidnimi zaporedji v celotni podatkovni zbirki nr (angl.
Pri izračunu dDDH se uporabi poravnava dveh nerazrezanih genomov z algoritmom BLASTn, pri čemer dobimo set visokotočkovnih ujemanj (ang.
BLASTN je orodje s katerim lahko primerjamo dobljeno nukleotidno zaporedje z nukleotidnimi zaporedji v podatkovni zbirki GenBank genomskih knjižnic.
Kumulativno sekvenco novega zaporedja smo nato vnesli v BLASTn, kjer smo ga primerjali z bazo vseh znanih sekvenc.
Orodje BLASTn deluje samo v angleščini, zato imamo imena izolatov na dendrogramih izpisana v angleškem jeziku.
Domnevne plazmidne sekvence smo analizirali z orodjem blastn na strežniku NCBI z uporabo baze core_nt.
Dobljeno nukleotidno zaporedje smo s pomočjo BLASTn primerjali z zaporedji iz podatkovnih zbirk javno dostopnih zaporedij.
Pregledali smo, katere metagenomske skupine imajo najvišji rezultat BLASTn glede na 27 izolatov, ki smo jih pridobili v tem delu.
Pomnožke smo analizirali z BlastN orodjem in jih primerjali z obstoječimi sevi v bazi podatkov.
Primerjavo zaporedij smo opravili z orodjem BLASTn, ki prav tako omogoča izris filogenetskega drevesa.
Ostali rezultati niso bili dovolj kakovostni, da bi lahko z BLASTn ugotovili zadostno ujemanje.
Nukleotidna zaporedja odčitkov viroidov izboljšane kakovosti smo nato poravnali (BLASTn) na pripadajoče referenčne genome.