sorodni izrazi in sinonimi v sodobni slovenščini, hrvaščini in srbščini
Podobnost besed in fraz med rezultati je odvisna od tega, kolikokrat se beseda
ali fraza pojavi v podobnem stavčnem kontekstu kot "consurf".
Podobni izrazi in sinonimi za
Kliknite za poizvedbo
Pogosto skupaj z
Primeri iz korpusa
Korpus Common Crawl
Common Crawl je korpus spletnih strani
Consurf je od nas zahteval, da mu povemo, katera je primarna oz. referenčna sekvenca, glede na katero želimo primerjati vse ostale sekvence.
Ker esencialnost encima ni zadosten pogoj za razvoj novih učinkovin, bomo izbranim encimom z orodjem ConSurf določili stopnjo evolucijske ohranjenosti aminokislinskih ostankov.
Ohranjenost je klasificirana z barvno lestvico ConSurf - vijolična barva označuje visoko ohranjena, bela srednje ter turkizna barva slabo ohranjena mesta zaporedja.
S tem postopkom smo pridobili ustrezna dokumenta, ki smo ju kasneje uporabili pri poizvedbi evolucijske ohranjenosti s spletnim orodjem ConSurf.
Omenjeno vizualizacijo vezavnih mest je bilo smiselno predstaviti tudi glede na obarvanost po barvni lestvici evolucijske ohranjenosti iz strežnika ConSurf.
Poleg tega smo pri pregledu rezultatov poizvedbe z orodjem ConSurf ugotovili, da so vse omenjene aminokisline visoko evolucijsko ohranjene.
Z uporabo Consurf barvne skale (cian-vijolična barva) lahko s programom opazujemo ohranjenost amino/nukleo-ostankov bioloških makromolekul.
Slednjim smo dodali še podatke o evolucijski ohranjenosti aminokislin, ki smo jih pridobili pri poizvedbi z orodjem ConSurf.
Rezultatom smo dodali še podatke o deležu visoko ohranjenih aminokislin, ki smo jih pridobili s pomočjo analize ConSurf.
Sledila je uporaba "sequence" orodja, s pomočjo katerega smo s fluorescentno zeleno barvo poudarili tiste aminokisline, ki v programu ConSurf predstavljajo 100-% ohranjenost.
Za naš protein je imel ConSurf že predhodno izvedeno analizo, zato smo v nekaj sekundah pridobili rezultate.
Podatke smo pridobili s spletnim strežnikom ConSurf, do katerega smo dostopali na naslovu consurf.tau.ac.il.
Če lastne datoteke multiple poravnave sekvenc ne bi imeli, bi jo ustvaril strežnik ConSurf.
Spletni strežnik ConSurf, je namenjen prepoznavanju regij pomembnih za strukturo in/ali delovanje proteina.
Ker je odgovoren za katalitsko funkcijo, je njegova ohranjenost visoka, in sicer ocena 8 (ConSurf).
S programom ConSurf smo izbrali tiste aminokisline, ki so imele oceno evolucijske ohranjenosti 9.
S tem postopkom smo molekulo encima obarvali po barvni lestvici ConSurf.
Podatke o evolucijski ohranjenosti vezavnih mest iz programa ConSurf za protein AcrB smo uporabili tudi za analizo evolucijske ohranjenosti skupkov vezavnih mest.
S fluorescentno zeleno barvo so označene aminokisline, ki v programu ConSurf predstavljajo 100- % ohranjenost.
Rezultatom smo dodali še podatke o deležu aminokislin z oceno ConSurf 9.